Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GPS1Q13098 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms