Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PRDM2Q13029 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PRDM2Q13029 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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