Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CPSF1Q10570 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
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