Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms