Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TTPAP49638 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TTPAP49638 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TTPAP49638 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.4 ms