Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
PTPRGP23470 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms