Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
PTPRBP23467 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPRBP23467 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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