Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms