Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDAP2Q9NXN4 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms