Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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