Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SAMD8Q96LT4 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SAMD8Q96LT4 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms