Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CRELD1Q96HD1 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms