Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SNX29Q8TEQ0 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms