Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 C2orf83-204ENST00000641422 291 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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ANKRD39Q53RE8 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
ANKRD39Q53RE8 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
ANKRD39Q53RE8 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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