Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDO1Q16878 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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