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| UPP1 | Q16831 | RN7SKP299-201 | ENST00000606679 | 301 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC009268.2-201 | ENST00000621925 | 457 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC095031.1-201 | ENST00000623685 | 672 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC091534.1-201 | ENST00000548779 | 1751 nt | TSL 2 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | FAM214A-201 | ENST00000261844 | 4217 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC01111-201 | ENST00000518732 | 1663 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | CADM2-AS1-201 | ENST00000476021 | 2656 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | CENPE-201 | ENST00000265148 | 8612 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| UPP1 | Q16831 | APOH-201 | ENST00000205948 | 1176 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU5E-8P-201 | ENST00000363502 | 116 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-173P-201 | ENST00000364215 | 104 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA48.8-201 | ENST00000391324 | 134 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.598-201 | ENST00000410480 | 95 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTCO2P34-201 | ENST00000421994 | 607 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTND1P9-201 | ENST00000453775 | 944 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |