Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms