Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SGCBQ16585 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCBQ16585 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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