Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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