Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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ZFHX3Q15911 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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ZFHX3Q15911 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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ZFHX3Q15911 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
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ZFHX3Q15911 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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ZFHX3Q15911 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
ZFHX3Q15911 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZFHX3Q15911 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
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