Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCDC85BQ15834 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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