Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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SKIV2LQ15477 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SKIV2LQ15477 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SKIV2LQ15477 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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