Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SEC23BQ15437 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEC23BQ15437 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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