Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDCD1Q15116 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDCD1Q15116 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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