Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMCO1Q147U7 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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