Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PKP1Q13835 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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