Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CUL3Q13618 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms