Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PICALMQ13492 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms