Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
MKRN4PQ13434 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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