Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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