Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKP2Q13309 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKP2Q13309 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms