Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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