Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTGDRQ13258 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms