Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIN2BQ13224 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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GRIN2BQ13224 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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GRIN2BQ13224 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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GRIN2BQ13224 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIN2BQ13224 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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