Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NR1H3Q13133 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NR1H3Q13133 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms