Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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GRIK3Q13003 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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GRIK3Q13003 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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GRIK3Q13003 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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GRIK3Q13003 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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GRIK3Q13003 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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GRIK3Q13003 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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