Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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