Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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FOXD4Q12950 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXD4Q12950 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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