Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms