Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHRNEQ04844 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms