Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CENPEQ02224 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CENPEQ02224 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms