Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD8P13378 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD8P13378 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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