Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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SH3BP4Q9P0V3 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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SH3BP4Q9P0V3 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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SH3BP4Q9P0V3 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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