Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GOPCQ9HD26 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms