Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CCDC47Q96A33 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CCDC47Q96A33 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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