Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD42Q8N9B4 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD42Q8N9B4 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ANKRD42Q8N9B4 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD42Q8N9B4 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms