Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP6Q16828 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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