Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPROQ16827 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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PTPROQ16827 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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