Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SNAPC1Q16533 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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