Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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